台灣屬海島地形，北迴歸線（Tropical of Cancer）橫向通過，跨熱帶與亞熱帶，島內二千公尺以上高山有四百多座，最高玉山（Yu Shan）達四千公尺，因而有寒、溫、熱帶的氣溫，與高山、丘陵、平原、海洋等各型的氣侯，所以適合各種環境下生存的植物，故藥用植物資源豐富，素為世界植物學者所公認。 台灣島內的植物自1854年英人 R. Fortuna 調查研究以來，經百餘年之歷代植物學者的努力探討，對於藥用植物資源及有效成分等之研究已有豐碩的成果。根據由台灣大學植物系主編於1994~2003年相繼出版的第二版台灣植物誌（Flora of Taiwan），共收錄4,339種植物，有4,077種原產於臺灣，其中有1,067種為臺灣特有植物（endemic plants），未見於世界其他地方。2003年由行政院衛生署中醫藥委員會主導，委由藥用植物的專家學者歐潤芝、陳忠川及陳益昇等著的台灣藥用植物資源名錄（The Catalogue of Medicinal Plant Resources in Taiwan）之記載共有2,583種重要的藥用植物。
